Die Probenahme erfolgt mit Abklatschplatten. Das sind mit einem Nährboden gefüllte Petrischalen. Als Nährböden eignet sich z. B. CASO-Agar (Casein-Sojamehl-Pepton-Agar). Die abklatschplatte wird auf die zu beprobende Stelle gedrückt, danach verschlossen und im Labor bei 36 °C für 48h und danach bei 22 °C bis zu 7 Tage in einem Brutschrank (syn. Inkubator) bebrütet.
In der Bebrütungszeit wachsen auf dem Nährboden Kolonien von Bakterien und Pilzen, die mit dem Auge erkennbar sind, aber oft nur mikroskopisch ausgezählt werden. Mehr als 10 derartige Kolonie bildende Einheiten pro cm2 (KbE/cm2) weisen auf bedenkliche Desinfektion, mehr als 15 KbE/cm2 auf Desinfektionsmisserfolg hin.